Teadlased on avastanud Brasiilias uue viiruse, mille DNA moodustab 90 protsenti teadusele tundmatutest geenidest. Avastuse tulemused avaldatakse bioRxivi eeltrükisaidil.
Viirus tuvastati Brasiilia linnas Belo Horizonte linnas Pampulha tehisjärves. Selle mitte eriti keeruline genoom koosneb peaaegu täielikult teadusele tundmatutest geenidest. Autorid nimetasid uut viirust Yaravirus brasiliensis Lõuna-Ameerika rahvaste mütoloogiast pärit vesinümfi Yara järgi.
Teadlased spekuleerivad, et nad seisavad silmitsi tundmatu isoleeritud viiruste rühma või hiiglasliku viiruse kaugema liigi, mis on muutunud väiksemaks vormiks, esimese juhtumiga.
Ainult 21. sajandil avastatud hiiglaslike viiruste suurus on võrreldav bakterirakkude omadega. Oma nime said nad tohutute kapsiidide - virionide kapseldavate valkude membraanide - tõttu - viiruseosakesed. Neil on ka sobiva pikkusega DNA, mis ületab 200 tuhat aluspaari ja sisaldab sageli niinimetatud orbude ehk orbude geene (ORFan), mida ei leidu üheski teises organismirühmas.
Komplekssed genoomid võimaldavad hiiglaslikel viirustel sünteesida valke ja teostada seetõttu DNA parandamist, replikatsiooni, transkriptsiooni ja translatsiooni. Enne nende avastamist usuti, et viirustel pole selliseid võimeid, kuna tegemist on inertsete olenditega, kes saavad nakatada ainult oma peremehi. Kõik teadaolevad hiiglaslikud viirused on amööbide parasiidid.
Ja kuigi uue mikroorganismi suurus on märkimisväärselt väiksem kui hiiglaslike viiruste oma - umbes 80 nanomeetrit -, parasiteerib see ka amööbe ja selle genoom on peaaegu täielikult orv: 68 tema geeni (üle 90 protsendi) ei leia analooge ühestki tuntud organismist ja ainult kuus ebamääraselt sarnane teadusele teadaolevatega.
"Selle põhjuseks on see, et viirus on uus imelise päritolu ja fülogeneesiaga ameemilise viiruse sugupuu," ütles üks uuringu juhte Jônatas Abrahão Brasiilia Minas Gerais 'föderaalülikoolist pressiteates.
Teadlased on analüüsinud enam kui kaheksat ja pool tuhat metagenoomi, kuid pole nende hulgast leidnud uue mikroorganismiga seotud viirusi. Nagu teised selle rühma viirused, on seda esindatud kaheahelalise DNA-ga, mille pikkus on 44 900 aluspaari ja sisaldab 74 kodeerivat fragmenti.
Reklaamvideo:
"Standardprotokolle kasutades ei õnnestunud meie esimeses geenianalüüsis tuvastada yaraviiruses mingeid äratuntavaid kapsiidijärjestusi ega muid klassikalisi viiruse geene," selgitab Yonatas Abrajao ja teise uuringu juht Bernard La Scola Aix-Marseille ülikoolist Prantsusmaa.
Ametlike metagenoomiliste protokollide kohaselt ei saa yaraviirust isegi viiruse tekitajana tuvastada, kuna sellel puudub selge sarnasus nendega. Teadlased ei oska veel öelda, milline ta tegelikult on - täiesti uue rühma esindaja või hiiglasliku viiruse järeltulija, mis kuidagi arenes väiksemaks vormiks.
"Tundmatute valkude arv, mis moodustavad yaraviiruse osakesi, peegeldab viiruste maailmas esinevat varieeruvust ja seda, kui palju uusi viiruse genoome on veel avastamata," järeldavad autorid.
