Aastal 1531 laskus Francisco Pizarro esimesena praeguse Ecuadori rannikule. Seal avastas ta impeeriumi, mis ulatus Lõuna-Ameerika läänerannikut mööda ligi kolm tuhat miili. See oli inkade suur impeerium.
Selle impeeriumi rahvaarv oli 16 miljonit inimest, see oli suurem kui ükski sel ajal eksisteerinud Euroopa riik. Impeerium oli hästi juhitud. Iga kodanik töötas ja osariigi aiad olid vilja täis, nii et keegi polnud näljane, isegi kui ühes provintsis oli vilets saak. Head teed viisid riigi kõigisse piirkondadesse, nii et uudised ja seadlused jõudsid igasse küla.
Inkade impeeriumis oli elu täielikult kontrollitud ja kõik olid nii kuulekad, et võib-olla just seetõttu impeerium varises kokku. Kui Pizarro oma 180 sõduriga impeeriumisse tungis, puhkes konflikt inkade juhtide Huascari ja tema poolvenna Atahualpa vahel, kes peaks olema valitseja. Atahualpa võitis.
Pizarro vallutas ta riigireetmise teel. Samal ajal tabati Huascar ja ta tapeti. Siis tappis Pizarro ka Atahualpa. Inkade impeerium jäi juhist ilma ega suutnud vastu seista Hispaania sissetungile.
Ameerika indiaanlased olid harjunud kuuletuma, kuid nüüd andsid korralduse Hispaania vallutajad. Hispaanlasi huvitas inkade mineraalide kaevandamine, mistõttu nad sundisid neid kaevandustes töötama. Põllumajanduse, mille nad unarusse jätsid. Paljud indiaanlased surid raske töö ja toidupuuduse tõttu. Inkade impeerium langes lagunemiseni.
Paljud indiaanlased elasid selle perioodi üle ja nende järeltulijatest sai Andide peamine elanikkond Ecuadoris, Peruus ja Boliivias.
