Nüüd New Yorgis toimuval aastakonverentsil Genome 10K konsortsiumi osalised teatasid rahvusvahelise projekti "Selgroogsete genoomid" käivitamisest, selle ülesanne on koguda kõigi täna planeedil elavate 66 tuhande selgroogsete liigi genoomid. Gizmodo räägib lähemalt projekti eesmärkidest ja eesmärkidest.
2009. aastal asutasid Ameerika bioloogid David Haussler, Oliver Ryder ja Stephen O'Brien projekti Genome 10K, mille eesmärk oli järjestada 10 000 selgroogsete genoomi. Esialgu osales projektis 55 teadlast suurtest loomaaedadest, uurimiskeskustest ja muuseumidest. Esialgu oli ebaselge, kui kaua piisava kvaliteediga genoomide kokku võtmine aega võtab. Kuid järjestamismeetodite kulude ja lihtsustamisega selgus, et projekt täidab oma ülesanded mõne aasta pärast. Viimase kolme aasta jooksul on projektis osalejad võrrelnud DNA järjestamise peamisi tehnoloogiaid ja saadud tulemuste analüüsi, et valida selline, mis loob "plaatina genoomid".
Eile teatasid Genome 10K liikmed uue selgroogsete genoomide projekti käivitamisest, mille eesmärk on koguda 66 000 selgroogsete liigi isas- ja naisgenoomi. Projektis osaleb 150 teadlast, kes esindavad 50 organisatsiooni 12 riigist. Projekti ühe asutaja Oliver Ryderi sõnul suudavad bioloogid aru saada liikide väljasuremise põhjustest, sealhulgas sellest, kas liigi ajaloos on olnud tihedalt seotud ristamisi, "kitsaskohti", mille tagajärjel võib liikide geneetiline mitmekesisus või kustutused - mutatsioonid, mis võivad "välja lülituda". »Organismi ellujäämiseks vajalikud geenid.
Koos uue projekti väljakuulutamisega esitasid teadlased kohe selle töö esimesed tulemused: 15 selgroogsete liigi genoomid, sealhulgas Uus-Meremaale endeemiline ohustatud kakapo-öökull-papagoi ja Austraalia platypus. Need ja kõik muud genoomid, mida teadlased plaanivad koguda, avaldatakse üldkasutatavas andmebaasis Noa laeva genoomika andmebaasis.
Osalejad kavatsevad järjestada genoomse DNA lühikesed lõigud ja koguda neist järjest pikemaid järjestusi kuni kogu kromosoomini ning seejärel need "liimida", kasutades spetsiaalselt projekti jaoks välja töötatud algoritme.
Varem suutsid teadlased inimese genoomi lugeda nutitelefoni mõõtu taskusekventorist. Seade püstitas DNA molekuli pikima lugemise rekordi, see suutis järjestada järjestusi kuni 882 tuhande aluspaarini.
Jekaterina Rusakova
