See leid uuendas arutelu hiiglaslike viiruste koha üle evolutsioonipuul. Kas need on viirused või elusrakud, mis on kaotanud võime iseseisvalt paljuneda?
Austria mikrobioloogid on avastanud viiruse, mis eristub sugulastest seadme suuruse ja keerukuse poolest. Ida-Austrias Klosterneuburgi linna reoveest leitud "rekordiomaniku" läbimõõt on umbes 400 nanomeetrit ja genoomi suurus on 1570 tuhat aluspaari (355 geeni). Avastuskoha auks pandi viirus nimeks Klosneuvirus. Leidust teatab ajakiri Science.
Viirus avastati metagenoomikameetodite arsenali abil. Lihtsamalt öeldes pandi viiruse genoom tükkhaaval kokku proovidest leitud fragmentidest. See lähenemine võimaldab teadlastel uurida kõigi proovikeskkonnas leiduvate mikroorganismide geenikomplekti ilma nende laboris kasvatamiseta. Töö autorid ise hindavad leiut saavutatud faktina ja teatavad kolme lähedase liigi tõenäolisest avastamisest lähipiirkonnas.
Avastus taaselustas arutelu selle üle, kas viimase pooleteise aastakümne jooksul perioodiliselt avastatud hiiglaslikud viirused on viirused selle sõna ranges tähenduses või on meil endised elusrakud, millest kunagi said parasiidid ja kes olid pikal evolutsiooniteel, kaotanud koos nende kohanemistega üsna palju geneetilist teavet, mis kodeeris "ära visatud". Sel juhul näib loogiline eraldada need eraldi domeeniks, mis võrdub bakterite, eukarüootide ja arheedega.
Mõnede teadaolevate viiruste suurused: Poliomüeliidiviirus ~ 30 nm. Zika viirus ~ 45 nm. Adenoviirus ~ 90 nm. HIV-1 ~ 120 nm. Mimiviirus ~ 400 nm
Tõepoolest, enamik viirusi on palju väiksemad kui rakud, kuhu nad tungivad, ja nende geneetiline materjal on väga tagasihoidliku suurusega. Mõne tüüpi lindude ja sigade viiruste paljunemine maksab ainult kaks geeni, võrreldes tuhandete isegi tavalise bakteriga. Näiteks sisaldab tuntud E. coli 4400 geeni - ja see pole veel rekord. Tuntud hiiglaslikud viirused (esimene avastati 2003. aastal ja neid on kokku kirjeldatud umbes pool tosinat) sisaldavad mõlemas umbes ühte või kahte tuhat geeni, mis ületab selgelt arvu, mis on minimaalne raku "hõivamiseks" ja selle edaspidiseks kasutamiseks. Mõned organismid, mis on teadaolevalt võimelised iseseisvaks eluks ja paljunemiseks, maksavad vähem.
Skeptikud ei näe vajadust neljanda domeeni järele, seletades hiiglaslike viiruste geneetilist üleliigsust peremeesmaterjali laenamisega. Näiteks Evgeny Kunin (Riiklik biotehnoloogiaalase teabe keskus, Bethesda, Maryland) nimetab "kristallselgeks", et hiiglaslikud viirused kuuluvad rühmadesse, mis hõlmavad palju väiksemaid vorme. Üldiselt on avastuse autorid ise sellele vaatenurgale kaldu. Kolleegidega koostööd tehes näitasid nad, et hiiglaslikud viirused laenasid geneetilist materjali järk-järgult erinevatelt hostidelt. "Neljanda domeeni kohta pole tõendeid ja see dokument kinnitab seda," ütleb Curtis Suttle, Kanada Vancouveris asuva Briti Columbia ülikooli viroloog.
Lisaks seavad skeptikud kahtluse alla avastamise fakti. Marseille'i ülikooli mikrobioloog Didier Raoult märgib, et enne genoomist evolutsiooni kohta järelduste tegemist oleks tore näha selle omanikku. Geenide järjestus on iseenesest väike argument: nad vahetavad sageli kohti ja läbivad muid muutusi, mis varjavad nende päritolu.
Reklaamvideo:
Sergei Sysoev
