Geneetikud on dekodeerinud katku bacilluse, bakteri, mis laastas 14. sajandil Euroopat, genoomi. Selgus, et surmav katkukepp on peaaegu kahjutu „vanaema“eristamatu
2011. aasta augustis said USA, Saksamaa ja Kanada ülikoolide teadlased, eesotsas Tuebingeni ülikooliga Johannes Krause, esimesed osalised andmed katku Bacillus Yersinia pestis DNA kohta, mis tappis 14. sajandi ühe viie aasta jooksul 30 miljonit inimest. … Selleks uurisid geneetikud Londoni East Smithfieldi kalmistule 1348. aastal maetud katkuohvrite luid ja hambaid.
Augusti paberlehes taastasid teadlased ümmarguse DNA, mis asub väljaspool kromosoome ja mida bakterid vajavad inimese immuunsust pärssivate valkude sünteesimiseks. See DNA - plasmiid pPCP1 - bioloogid võrdles genoomi sarnaste osadega tänapäevastes katkukeppides, mille järel nad jõudsid järeldusele, et 14. sajandi katku batsill suri välja, jätmata järeltulijaid.
Viimases uuringus, mille tulemused ilmusid ajakirjas Nature, kasutasid Dr Krause ja tema kolleegid Yersinia pestise täieliku genoomi kokkupanemiseks juba väljakujunenud tehnikat.
Nad valisid East Smithfieldi haudadest mitu hästi säilinud hammast. Bakteri genoomi jäänused leiti hammaste kroonidelt ja juurtelt. Geneetika nelja miljoni nukleotiidi suurune pusle koostati arvutiprogrammi abil.
Nagu teadlased märgivad, on Yersinia pestise genoomi dekodeerimise täpsus kõrge - võrreldav inimese genoomi dekodeerimise täpsusega.
Tõsi, surmava bakteri genoomis jäid ikkagi valged laigud: bioloogid on taastanud 93,5% geneetilisest "puslest" - ülejäänud osad on lahustunud East Smithfieldi masshauas.
Musta surma vanaema
Dr Krause meeskond võrdles saadud DNA struktuuri tänapäevase katku batsilli (tüvi CO92) genoomiga. Selgus, et enamik kromosoomide ja plasmiidide geene langeb kokku, kuid mõned piirkonnad puuduvad tänapäevastes bakterites täielikult või on need asendatud teiste DNA järjestustega.
Reklaamvideo:
Keskaegse bakteri genoomis on teadlased avastanud ka geenid, mis ühendavad Yersinia pestise kõige iidsemad tüved nende ühise esivanema, Yersinia pseudotuberculosis bakteriga.
"See näitab, et Yersinia pestise genoom on viimase 600 aasta jooksul vähe muutunud, vaatamata mitmele epideemiale ja aktiivsele inimesele haigustekitajate vastu võitlemiseks," - väidavad teadlased võrdleva analüüsi tulemusi kokku võttes.
